<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">gastro-j</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, Coloproctology</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1382-4376</issn><issn pub-type="epub">2658-6673</issn><publisher><publisher-name>«Gastro» LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.22416/1382-4376-2024-34-5-59-74</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">gastro-j-1117</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Основные молекулярно-биологические, метаболические и иммунологические механизмы трансплантации фекальной микробиоты</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Basic Molecular Biology, Metabolic and Immunological Mechanisms of Fecal Microbiota Transplantation</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-0736-1269</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Голощапов</surname><given-names>О. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Goloshchapov</surname><given-names>O. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Голощапов Олег Валерьевич* — кандидат медицинских наук, заведующий отделением реанимации и интенсивной терапии № 3, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой, ассистент кафедры анестезиологии и реаниматологии, Первый Санкт-Петербургский ГМУ им. академика И.П. Павлова.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Oleg V. Goloshchapov — Cand. Sci. (Med.), Head of the Intensive Care Unit No. 3, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation; Teaching Assistant at the Department of Anesthesiology and Intensive Care.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">golocht@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Бейнарович</surname><given-names>А. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Beynarovich</surname><given-names>A. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Бейнарович Анастасия Викторовна — врач-гематолог отделения трансплантации костного мозга для взрослых, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Anastasia V. Beynarovich — Clinical Hematologist, Department of Adult Bone Marrow Transplantation, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">beynarovichn@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9703-4378</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Чухловин</surname><given-names>А. Б.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Chukhlovin</surname><given-names>A. B.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Чухловин Алексей Борисович — доктор медицинских наук, профессор, заведующий лабораторией трансплантологии, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Alexey B. Chukhlovin — Dr. Sci. (Med.), Professor, Head of the Transplantology Laboratory, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation; Teaching Assistant at the Department of Anesthesiology and Intensive Care.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">alexei.chukh@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-5493-4106</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Клементьева</surname><given-names>Р. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Klementeva</surname><given-names>R. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Клементьева Руслана Викторовна — врач анестезиолог-реаниматолог отделения реанимации и интенсивной терапии № 3, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Ruslana V. Klementeva — Anesthesiologist-Resuscitator of the Resuscitation and Intensive Care Unit No. 3, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">klementeva85@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-4522-4465</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Щербаков</surname><given-names>А. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shcherbakov</surname><given-names>A. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Щербаков Александр Александрович — врач — анестезиолог-реаниматолог отделения реанимации и интенсивной терапии № 3, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Alexander A. Shcherbakov — Anesthesiologist-Resuscitator of the Resuscitation and Intensive Care Unit No. 3, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">xihmrx@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5694-4348</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Бакин</surname><given-names>Е. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Bakin</surname><given-names>E. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Бакин Евгений Александрович — кандидат технических наук, старший научный сотрудник отдела онкологии, гематологии и трансплантологии для подростков и взрослых.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Evgeny A. Bakin — Cand. Sci. (Techn.), Senior Researcher, Department of Oncology, Hematology and Transplantology for Adolescents and Adults, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation; Pavlov FSPSMU.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">eugene.bakin@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0469-7338</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Голубовская</surname><given-names>И. К.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Golubovskaya</surname><given-names>I. K.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Голубовская Ирина Константиновна — кандидат медицинских наук, врач-гематолог поликлинического отделения с дневным стационаром для взрослых, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Irina K. Golubovskaya — Cand. Sci. (Med.), Hematologist of the Outpatient Department with Day Hospital for Adults, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">dr.irinagolubovskaya@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9793-8358</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Венцловайте</surname><given-names>Н. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ventslovayte</surname><given-names>N. D.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Венцловайте Наталья Дмитриевна — младший научный сотрудник научно-исследовательского клинического отдела вирусных гепатитов и заболеваний печени у детей.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 9</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Natalia D. Ventslovayte — Junior Researcher, Research Clinical Department of Viral Hepatitis and Liver Diseases in Children.</p><p>197022, Saint Petersburg, Professora Popova str., 9</p></bio><email xlink:type="simple">ventslovayte.nd@mail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9501-9860</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Юдинцева</surname><given-names>О. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Yudintseva</surname><given-names>O. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Юдинцева Олеся Сергеевна — врач-гематолог, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Olesya S. Yudintseva — Clinical Hematologist, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">olesyayudintceva@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4780-2778</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Горчакова</surname><given-names>М. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gorchakova</surname><given-names>M. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Горчакова Маргарита Валерьевна — биолог лаборатории клинической иммунологии и молекулярной диагностики.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Margarita V. Gorchakova — Biologist of the Laboratory of Clinical Immunology and Molecular Diagnostics.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">rita.gorchakova@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7972-1286</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Карев</surname><given-names>В. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Karev</surname><given-names>V. E.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Карев Вадим Евгеньевич — заведующий научно-исследовательским клиническим отделом тканевых и патоморфологических методов исследования.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 9</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Vadim E. Karev — Head of the Research Clinical Department of Tissue and Pathomorphological Research Methods, Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases under the Federal Medical Biological Agency.</p><p>197022, Saint Petersburg, Professora Popova str., 9</p></bio><email xlink:type="simple">vadimkarev@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-6114-3214</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кучер</surname><given-names>М. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kucher</surname><given-names>M. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Кучер Максим Анатольевич — доктор медицинских наук, руководитель отдела клинического питания, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой, доцент кафедры гематологии, трансфузиологии и трансплантологии с курсом детской онкологии факультета последипломного образования, ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский ГМУ им. академика И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Maxim A. Kucher — Dr. Sci. (Med.), Head of Clinical Nutrition Department, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation, Associate Professor of the Department of Hematology, Transfusiology and Transplantology with a course in Pediatric Oncology, Faculty of Postgraduate Education.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">doctorkucher@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6292-0385</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Суворова</surname><given-names>М. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Suvorova</surname><given-names>M. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Суворова Мария Александровна — кандидат биологических наук, генеральный директор Научно-исследовательской лаборатории.</p><p>197022, Санкт-Петербург, Каменноостровский пр., 42б</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Mariia A. Suvorova — Cand. Sci. (Biol.), Director General of the Explana Research Laboratory.</p><p>197022, Saint Petersburg, Kamennoostrovsky Ave, 42B</p></bio><email xlink:type="simple">maria_suvorova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9540-5980</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Светкина</surname><given-names>Е. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Svetkina</surname><given-names>E. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Светкина Екатерина Владимировна — врач клинической лабораторной диагностики отдела лабораторной диагностики, ФГБУ «Всероссийский центр экстренной и радиационной медицины им. А.М. Никифорова» Министерства Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий.</p><p>194044, Санкт-Петербург, ул. Академика Лебедева, 4/2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Ekaterina V. Svetkina — Clinical Laboratory Diagnostics Doctor of the Laboratory Diagnostics Department, А.М. Nikiforov Russian Center of Emergency and Radiation Medicine» of the Ministry of Russian Federation for Civil Defense, Emergencies and Elimination of Consequences of Natural Disasters.</p><p>194044, Saint Petersburg, Akademika Lebedeva str., 4/2</p></bio><email xlink:type="simple">svetkina.evl@gmail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Родионов</surname><given-names>Г. Г.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Rodionov</surname><given-names>G. G.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Родионов Геннадий Георгиевич — доктор медицинский наук, доцент, ведущий научный сотрудник, заведующий научно-исследовательской лабораторией токсикологии и лекарственного мониторинга научно-исследовательского отдела биоиндикации, «Всероссийский центр экстренной и радиационной медицины им. А.М. Никифорова» Министерства Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий.</p><p>194044, Санкт-Петербург, ул. Академика Лебедева, 4/2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Gennadij G. Rodionov — Dr. Sci. (Med.), Docent, Leading Researcher, Head of the Research Laboratory of Toxicology and Drug Monitoring of the Research Department of Bioindication, The Ministry of Russian Federation for Civil Defense.</p><p>194044, Saint Petersburg, Akademika Lebedeva str., 4/2</p></bio><email xlink:type="simple">rodgengeor@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3480-8089</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гостев</surname><given-names>В. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gostev</surname><given-names>V. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Гостев Владимир Валерьевич — кандидат биологических наук, старший научный сотрудник научно-исследовательского отдела медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии, ФГБУ «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства»; доцент кафедры медицинской микробиологии, Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 9</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Vladimir V. Gostev — Cand. Sci. (Biol.), Senior Researcher, Research Department of Medical Microbiology and Molecular Epidemiology, Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases under the Federal Medical Biological Agency; Associate Professor at the Department of Medical Microbiology.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 9</p></bio><email xlink:type="simple">guestvv11@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-5"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-3550-7875</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сидоренко</surname><given-names>С. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Sidorenko</surname><given-names>S. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Сидоренко Сергей Владимирович — доктор медицинских наук, профессор, заведующий научно-исследовательским отделом медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии, ФГБУ «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства»; профессор кафедры медицинской микробиологии, Северо-Западный ГМУ им. И.И. Мечникова.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 9</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sergey V. Sidorenko — Dr. Sci. (Med.), Professor, Head of the Research Department of Medical Microbiology and Molecular Epidemiology, Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases under the Federal Medical Biological Agency; Professor of the Department of Medical Microbiology.</p><p>197022, Saint Petersburg, Professora Popova str., 9</p></bio><email xlink:type="simple">sidorserg@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-5"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4332-0114</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Моисеев</surname><given-names>И. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Moiseev</surname><given-names>I. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Моисеев Иван Сергеевич — доктор медицинских наук, заместитель директора по науке НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Ivan S. Moiseev — Dr. Sci. (Med.), Deputy Director for Research, R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">moisiv@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9589-4136</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кулагин</surname><given-names>А. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kulagin</surname><given-names>A. D.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Кулагин Александр Дмитриевич — доктор медицинских наук, профессор, директор НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, 6–8</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Alexander D. Kulagin — Dr. Sci. (Med.), Professor, Director, R.   Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantation,.</p><p>197022, Saint Petersburg, L’va Tolstogo str., 6–8</p></bio><email xlink:type="simple">kulagingem@rambler.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. Р.М. Горбачевой, ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. академика И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>R. Gorbacheva Memorial Research Institute of Pediatric Oncology, Hematology and Transplantology, Pavlov First Saint Petersburg State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases under the Federal Medical Biological Agency</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-3"><aff xml:lang="ru"><institution>Научно-исследовательская лаборатория «Explana»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Explana Research Laboratory</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-4"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ «Всероссийский центр экстренной и радиационной медицины им. А.М. Никифорова» Министерства Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>А.М. Nikiforov Russian Center of Emergency and Radiation Medicine of the Ministry of Russian Federation for Civil Defense, Emergencies and Elimination of Consequences of Natural Disasters</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-5"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства»; ФГБОУ ВО «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases under the Federal Medical Biological Agency; North-Western State Medical University named after I.I. Mechnikov</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2024</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>04</day><month>12</month><year>2024</year></pub-date><volume>34</volume><issue>5</issue><fpage>59</fpage><lpage>74</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Голощапов О.В., Бейнарович А.В., Чухловин А.Б., Клементьева Р.В., Щербаков А.А., Бакин Е.А., Голубовская И.К., Венцловайте Н.Д., Юдинцева О.С., Горчакова М.В., Карев В.Е., Кучер М.А., Суворова М.А., Светкина Е.В., Родионов Г.Г., Гостев В.В., Сидоренко С.В., Моисеев И.С., Кулагин А.Д., 2024</copyright-statement><copyright-year>2024</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Голощапов О.В., Бейнарович А.В., Чухловин А.Б., Клементьева Р.В., Щербаков А.А., Бакин Е.А., Голубовская И.К., Венцловайте Н.Д., Юдинцева О.С., Горчакова М.В., Карев В.Е., Кучер М.А., Суворова М.А., Светкина Е.В., Родионов Г.Г., Гостев В.В., Сидоренко С.В., Моисеев И.С., Кулагин А.Д.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Goloshchapov O.V., Beynarovich A.V., Chukhlovin A.B., Klementeva R.V., Shcherbakov A.A., Bakin E.A., Golubovskaya I.K., Ventslovayte N.D., Yudintseva O.S., Gorchakova M.V., Karev V.E., Kucher M.A., Suvorova M.A., Svetkina E.V., Rodionov G.G., Gostev V.V., Sidorenko S.V., Moiseev I.S., Kulagin A.D.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.gastro-j.ru/jour/article/view/1117">https://www.gastro-j.ru/jour/article/view/1117</self-uri><abstract><p>Цель представления клинического наблюдения: продемонстрировать основные молекулярно-биологические, метаболические и иммунологические эффекты трансплантации фекальной микробиоты (ТФМ) на примере редкого случая развития острой реакции «трансплантат против хозяина» с поражением кишечника (РТПХ ЖКТ) у пациентки после проведения аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК).</p><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. Для оценки основных, известных механизмов ТФМ было использовано таргетное секвенирование фрагментов V3–V4 участка гена 16S рРНК на платформе Miseq (16s секвенирования), мультиплексная полимеразная цепная реакция в режиме реального времени, хромато-масс-спектрометрия, иммунофенотипирование субпопуляций лимфоцитов, гистологический и иммуногистохимический методы исследования.</p></sec><sec><title>Клинический случай</title><p>Клинический случай. Пациентке 40 лет с диагнозом «миелодиспластический синдром», анамнезом двух неуспешных алло-ТГСК в связи с неприживлением трансплантата в качестве «терапии спасения» была выполнена третья гаплоидентичная ТГСК от отца. В связи с развитием в раннем посттрансплантационном периоде вирусно-бактериального колита (ассоциированного с полирезистентным штаммом K. pneumoniae и вирусом герпеса 6-го типа) на 46–47-е сутки после алло-ТГСК была выполнена ТФМ. После проведенной процедуры отмечалось полное разрешение симптомов энтеропатии. Однако на Д+106 после гаплоидентичной ТГСК в связи с детекцией минимальной остаточной болезни была отменена иммуносупрессивная терапия, что привело к развитию РТПХ по типу overlap-синдрома с поражением кожи 4-й степени, слизистых оболочек кишечника 3-й степени. Это потребовало возобновления и в последующем усиления иммуносупрессивной терапии, на фоне чего отмечалось полное разрешение симптомов РТПХ.</p><p>После выполнения ТФМ у пациентки отмечено полное разрешение клинических симптомов вирусно-бактериального колита. По результатам 16s секвенирования, значимо возросло видовое разнообразие фекальной микробиоты, выявлено уменьшение относительного количества условно-патогенных бактерий (род Klebsiella, Enterococcus, Streptococcus), уверенный рост комменсальных микроорганизмов: Bacteroides, появление родов Faecalibacterium, Blautia, Rozeburia. Развитие острой РТПХ ЖКТ, спровоцированной отменой такролимуса, способствовало повторному эпизоду обеднения микробиоты кишечника. По мере разрешения симптомов РТПХ на фоне возобновления иммуносупрессии был вновь зафиксирован рост индекса Шеннона, а состав фекальной микробиоты пациентки приблизился к таковому у донора. Состав микробиоты на всех клинических этапах — до и после ТФМ, в период максимальной манифестации симптомов острой РТПХ кишечника, усиления иммуносупрессивной терапии — оказывал влияние на метаболизм желчных, жирных кислот плазмы крови и на показатели иммунной системы.</p></sec><sec><title>Выводы</title><p>Выводы. ТФМ может быть частью терапии, направленной на раннюю реконституцию иммунной системы и обмена органических кислот, у пациентов после алло-ТГСК. Состав фекальной микробиоты, метаболический профиль и спектр субпопуляции лимфоцитов могут быть маркерами контроля комплексной реабилитации после алло-ТГСК.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Aim</title><p>Aim:  demonstration of basic molecular biological, metabolic and immunological effects of fecal microbiota transplantation (FMT), on the example of a rare case of acute graft-versus-host disease (GVHD) with intestinal damage in a patient after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (allo-HSCT).</p></sec><sec><title>Materials and methods</title><p>Materials and methods. To monitor the basic effects of FMT, we performed targeted DNA sequencing of 16S rRNA gene (V3–V4) using MiSeq platform as well as multiplex real-time PCR, MS/gas chromatography technique, immunophenotyping of blood lymphocytes, histological and immunohistochemical techniques.</p></sec><sec><title>Clinical case</title><p>Clinical case. A 40-year-old female patient diagnosed with myelodysplastic syndrome, with a history of two unsuccessful allo-HSCTs due to graft failure, underwent the third haploidentical HSCT (haplo-HSCT) from her father as ‘salvage’ therapy. Due to early viral/bacterial colitis post-transplant associated with a multidrug-resistant strain of K. pneumoniae and herpes virus type 6, FMT was performed on days 46 and 47 after allo-HSCT. Complete resolution of the enteropathy symptoms was noted following FMT. However, immunosuppressive therapy was canceled on D+106 after haplo-HSCT due to the detection of minimal residual disease causing development of the ‘overlap’-type GVHD with damage skin lesions grade 4, and intestinal mucous membranes grade 3. This complication required resumption and subsequent intensification of immunosuppressive therapy with complete resolution of GVHD symptoms. Following FMT treatment, the patient showed complete resolution of clinical colitis symptoms. According to results of 16S rRNA sequencing, the species-specific diversity of fecal microbiota increased significantly, along with decreased relative contents of opportunistic bacteria (Klebsiella, Enterococcus, Streptococcus genera). A significant growth was revealed for commensal Bacteroidota, and re-emergence of Faecalibacterium, Blautia, Roseburia. Acute gastrointestinal GVHD promoted by tacrolimus withdrawal was associated with repeated depletion of intestinal microbiota. Upon resolution of GVHD and resumed immunosuppression, increased microbiota diversity (Shannon index) was again recorded, and the parameters of patient’s fecal microbiota reached the donor values. The microbiota shifts at all clinical stages (before and after FMT, at the peak of acute intestinal GVHD and intensive immunosuppressive therapy) showed some relations with metabolism of bile and fatty acids in blood plasma and immune parameters.</p></sec><sec><title>Conclusions</title><p>Conclusions. FMT may be a component of complex therapy aimed at early reconstitution of immune system and organic acid metabolism in patients after allo-HSCT. The composition of fecal microbiota, metabolic profile and spectrum of lymphocyte subpopulations may be markers for monitoring complex rehabilitation after allo-HSCT.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>трансплантация фекальной микробиоты</kwd><kwd>реакция «трансплантат против хозяина»</kwd><kwd>аллогенная трансплантация гемопоэтических стволовых клеток</kwd><kwd>метаболом</kwd><kwd>желчные кислоты</kwd><kwd>субпопуляция лимфоцитов</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>fecal microbiota transplantation</kwd><kwd>graft-versus-host disease</kwd><kwd>allogeneic hematopoietic stem cell transplantation</kwd><kwd>metabolome</kwd><kwd>bile acids</kwd><kwd>lymphocyte subpopulation</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">анализ результатов выполнен при поддержке гранта РФФИ № 20-315-90083</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">data analysis was supported by the grants from Russian Foundation for Fundamental Studies No. 20-31590083</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sterling C., Webster J. Harnessing the immune system after allogeneic stem cell transplant in acute myeloid leukemia. Am J Hematol. 2020;95(5):529–47. DOI: 10.1002/ajh.25750</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sterling C., Webster J. Harnessing the immune system after allogeneic stem cell transplant in acute myeloid leukemia. Am J Hematol. 2020;95(5):529–47. DOI: 10.1002/ajh.25750</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">van Lier Y.F., Davids M., Haverkate N.J.E., de Groot P.F., Donker M.L., Meijer E., et al. Donor fe cal microbiota transplantation ameliorates intestinal graftversus-host disease in allogeneic hematopoietic cell transplant recipients. Sci Transl Med. 2020;12(556):eaaz8926. DOI: 10.1126/scitranslmed.aaz8926</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">van Lier Y.F., Davids M., Haverkate N.J.E., de Groot P.F., Donker M.L., Meijer E., et al. Donor fe cal microbiota transplantation ameliorates intestinal graftversus-host disease in allogeneic hematopoietic cell transplant recipients. Sci Transl Med. 2020;12(556):eaaz8926. DOI: 10.1126/scitranslmed.aaz8926</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kakihana K., Fujioka Y., Suda W., Najima Y., Ku wata G., Sasajima S., et al. Fecal microbiota transplantation for patients with steroid-resistant acute graft-versus-host disease of the gut. Blood. 2016;128(16):2083–8. DOI: 10.1182/blood-2016-05-717652</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kakihana K., Fujioka Y., Suda W., Najima Y., Ku wata G., Sasajima S., et al. Fecal microbiota transplantation for patients with steroid-resistant acute graft-versus-host disease of the gut. Blood. 2016;128(16):2083–8. DOI: 10.1182/blood-2016-05-717652</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Aziz M.D., Shah J., Kapoor U., Dimopoulos C., Anand S., Augustine A., et al. Disease risk and GVHD biomarkers can stratify patients for risk of relapse and nonrelapse mortality post hematopoietic cell transplant. Leukemia. 2020;34(7):1898–906. DOI: 10.1038/s41375-020-0726-z</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Aziz M.D., Shah J., Kapoor U., Dimopoulos C., Anand S., Augustine A., et al. Disease risk and GVHD biomarkers can stratify patients for risk of relapse and nonrelapse mortality post hematopoietic cell transplant. Leukemia. 2020;34(7):1898–906. DOI: 10.1038/s41375-020-0726-z</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Penack O., Marchetti M., Ruutu T., Aljurf M., Bacigalupo A., Bonifazi., et al. Prophylaxis and management of graft versus host disease after stem-cell transplantation for haematological malignancies: updated consensus recommendations of the European Society for Blood and Marrow Transplantation. Lancet Haematol. 2020;7(2):e157–67. DOI: 10.1016/S2352-3026(19)30256-X</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Penack O., Marchetti M., Ruutu T., Aljurf M., Bacigalupo A., Bonifazi., et al. Prophylaxis and management of graft versus host disease after stem-cell transplantation for haematological malignancies: updated consensus recommendations of the European Society for Blood and Marrow Transplantation. Lancet Haematol. 2020;7(2):e157–67. DOI: 10.1016/S2352-3026(19)30256-X</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mao D., Jiang Q., Sun Y., Mao Y., Guo L., Zhang Y., et al. Treatment of intestinal graft-versus-host disease with unrelated donor fecal microbiota transplantation capsules: A case report. Medicine (Baltimore). 2020;99(38):e22129. DOI: 10.1097/MD.0000000000022129</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mao D., Jiang Q., Sun Y., Mao Y., Guo L., Zhang Y., et al. Treatment of intestinal graft-versus-host disease with unrelated donor fecal microbiota transplantation capsules: A case report. Medicine (Baltimore). 2020;99(38):e22129. DOI: 10.1097/MD.0000000000022129</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Zama D., Bossù G., Leardini D., Muratore E., Bi agi E., Prete A., et al. Insights into the role of intestinal microbiota in hematopoietic stem-cell transplantation. Ther Adv Hematol. 2020;11:2040620719896961. DOI: 10.1177/2040620719896961</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zama D., Bossù G., Leardini D., Muratore E., Bi agi E., Prete A., et al. Insights into the role of intestinal microbiota in hematopoietic stem-cell transplantation. Ther Adv Hematol. 2020;11:2040620719896961. DOI: 10.1177/2040620719896961</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Schwabkey Z.I., Jenq R.R. Microbiome anomalies in allogeneic hematopoietic cell transplantation. Annu Rev Med. 2020;71:137–48. DOI: 10.1146/annurev-med-052918-122440</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Schwabkey Z.I., Jenq R.R. Microbiome anomalies in allogeneic hematopoietic cell transplantation. Annu Rev Med. 2020;71:137–48. DOI: 10.1146/annurev-med-052918-122440</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">DuPont H.L., Jiang Z.D., DuPont A.W., Utay N.S. Abnormal intestinal microbiome in medical disorders and potential reversibility by fecal microbiota transplantation. Dig Dis Sci. 2020;65(3):741–56. DOI: 10.1007/s10620020-06102-y</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">DuPont H.L., Jiang Z.D., DuPont A.W., Utay N.S. Abnormal intestinal microbiome in medical disorders and potential reversibility by fecal microbiota transplantation. Dig Dis Sci. 2020;65(3):741–56. DOI: 10.1007/s10620020-06102-y</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Голощапов О.В., Кучер М.А., Суворова М.А., Клементьева Р.В., Щербаков А.А., Швецов А.Н. и др. Первый опыт терапии полирезистентных инфекционных осложнений, ассоциированных с Clostridium difficile и Klebsiella pneumoniae, методом трансплантации фекальной микробиоты у пациентов после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток. Инфекционные болезни. 2017;15(3):65–74. DOI: 10.20953/1729-92252017-3-65-74</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Goloshchapov O.V., Kucher M.A., Suvorova M.A., Klement’eva R.V., Scherbakov A.A., Shvetsov A.N., et al. A first experience of therapy of multi-resistant infectious complications associated with Clostridium difficile and Klebsiella pneumoniae, using a method of fecal microbiota transplantation in patients after allogeneic hemopoietic stem cell transplantation. Infectious diseases. 2017;15(3):65–74. (In Russ.). DOI: 10.20953/1729-92252017-3-65-74</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bilinski J., Grzesiowski P., Sorensen N., Madry K., Muszynski J., Robak K., et al. Fecal microbiota transplantation in patients with blood disorders inhibits gut colonization with antibiotic-resistant bacteria: Results of a prospective, single-center study. Clin Infect Dis. 2017;65(3):364–70. DOI: 10.1093/cid/cix252</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bilinski J., Grzesiowski P., Sorensen N., Madry K., Muszynski J., Robak K., et al. Fecal microbiota transplantation in patients with blood disorders inhibits gut colonization with antibiotic-resistant bacteria: Results of a prospective, single-center study. Clin Infect Dis. 2017;65(3):364–70. DOI: 10.1093/cid/cix252</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Battipaglia G., Malard F., Rubio M.T., Ruggeri A., Mamez A.C., Brissot E., et al. Fecal microbiota transplantation before or after allogeneic hematopoietic transplantation in patients with hematologic malignancies carrying multidrug-resistance bacteria. Haematologica. 2019;104(8):1682–8. DOI: 10.3324/haematol.2018.198549</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Battipaglia G., Malard F., Rubio M.T., Ruggeri A., Mamez A.C., Brissot E., et al. Fecal microbiota transplantation before or after allogeneic hematopoietic transplantation in patients with hematologic malignancies carrying multidrug-resistance bacteria. Haematologica. 2019;104(8):1682–8. DOI: 10.3324/haematol.2018.198549</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Shogbesan O., Poudel D.R., Victor S., Jehangir A., Fadahunsi O., Shogbesan G., et al. Systematic review of the efficacy and safety of fecal microbiota transplant for Clostridium difficile infection in immunocompromised patients. Can J Gastroenterol Hepatol. 2018;2018:1394379. DOI: 10.1155/2018/1394379</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shogbesan O., Poudel D.R., Victor S., Jehangir A., Fadahunsi O., Shogbesan G., et al. Systematic review of the efficacy and safety of fecal microbiota transplant for Clostridium difficile infection in immunocompromised patients. Can J Gastroenterol Hepatol. 2018;2018:1394379. DOI: 10.1155/2018/1394379</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Голощапов О.В., Чухловин А.Б., Бакин Е.А., Станевич О.В., Клементьева Р.В., Щербаков А.А. и др. Трансплантация фекальной микробиоты при реакции «трансплантат против хозяина» у детей и взрослых: методы, клинические эффекты, безопасность. Терапевтический архив. 2020;92(7):43–54. DOI: 10.26442/00403660.2020.07.000773</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Goloshchapov O.V., Chukhlovin A.B., Bakin E.A., Stanevich O.V., Klementeva R.V., Shcherbakov A.A., et al. Fecal microbiota transplantation for graft-versus-host disease in children and adults: Methods, clinical effects, safety. Terapevticheskii arkhiv. 2020;92(7):43–54. (In Russ.). DOI: 10.26442/00403660.2020.07.000773</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kim C.H. Immune regulation by microbiome metabolites. Immunology. 2018;154(2):220–9. DOI: 10.1111/imm.12930</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kim C.H. Immune regulation by microbiome metabolites. Immunology. 2018;154(2):220–9. DOI: 10.1111/imm.12930</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Cacciatore S., Loda M. Innovation in metabolomics to improve personalized healthcare. Ann N Y Acad Sci. 2015;1346(1):57–62. DOI: 10.1111/nyas.12775</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Cacciatore S., Loda M. Innovation in metabolomics to improve personalized healthcare. Ann N Y Acad Sci. 2015;1346(1):57–62. DOI: 10.1111/nyas.12775</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Madsen R., Lundstedt T., Trygg J. Chemometrics in metabolomics — a review in human disease diagnosis. Anal Chim Acta. 2010;659(1–2):23–33. DOI: 10.1016/j.aca.2009.11.042</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Madsen R., Lundstedt T., Trygg J. Chemometrics in metabolomics — a review in human disease diagnosis. Anal Chim Acta. 2010;659(1–2):23–33. DOI: 10.1016/j.aca.2009.11.042</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Stringer K.A., McKay R.T., Karnovsky A., Quémerais B., Lacy P. Metabolomics and its application to acute lung diseases. Front Immunol. 2016;7:44. DOI: 10.3389/fimmu.2016.00044</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Stringer K.A., McKay R.T., Karnovsky A., Quémerais B., Lacy P. Metabolomics and its application to acute lung diseases. Front Immunol. 2016;7:44. DOI: 10.3389/fimmu.2016.00044</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Котрова А.Д., Шишкин А.Н., Воропаева Л.С., Лавренова Н.С., Слепых Л.А., Лукашенко М.В. и др. Гендерная оценка микробиома кишечника у больных с ожирением. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2021;194(10):91–9. DOI: 10.31146/1682-8658-ecg-194-10-91-99</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kotrova A.D., Shishkin A.N., Voropaeva L.S., Lavrenova N.S., Slepyh L.A., Lukashenko M.V., et al. Gender assess ment of the gut microbiome in obese patients. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2021;194(10):91–9. (In Russ.). DOI: 10.31146/1682-8658-ecg-194-10-91-99</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Phillips R. Rheumatoid arthritis: Microbiome reflects status of RA and response to therapy. Nat Rev Rheumatol. 2015;11(9):502. DOI: 10.1038/nrrheum.2015.109</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Phillips R. Rheumatoid arthritis: Microbiome reflects status of RA and response to therapy. Nat Rev Rheumatol. 2015;11(9):502. DOI: 10.1038/nrrheum.2015.109</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Taur Y., Jenq R.R., Perales M.A., Littmann E.R., Morjaria S., Ling L., et al. The effects of intestinal tract bacterial diversity on mortality following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. Blood. 2014;124(7):1174–82. DOI: 10.1182/blood-2014-02-554725</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Taur Y., Jenq R.R., Perales M.A., Littmann E.R., Morjaria S., Ling L., et al. The effects of intestinal tract bacterial diversity on mortality following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. Blood. 2014;124(7):1174–82. DOI: 10.1182/blood-2014-02-554725</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit22"><label>22</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Holler E., Butzhammer P., Schmid K., Hundsruck er C., Koestler J., Peter K., et al. Metagenomic analysis of the stool microbiome in patients receiving allogeneic stem cell transplantation: loss of diversity is associated with use of systemic antibiotics and more pronounced in gastrointestinal graft-versus-host disease. Biol Blood Marrow Transplant. 2014;20(5):640–5. DOI: 10.1016/j.bbmt.2014.01.030</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Holler E., Butzhammer P., Schmid K., Hundsruck er C., Koestler J., Peter K., et al. Metagenomic analysis of the stool microbiome in patients receiving allogeneic stem cell transplantation: loss of diversity is associated with use of systemic antibiotics and more pronounced in gastrointestinal graft-versus-host disease. Biol Blood Marrow Transplant. 2014;20(5):640–5. DOI: 10.1016/j.bbmt.2014.01.030</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit23"><label>23</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Stanimirov B., Stankov K., Mikov M. Bile acid signaling through farnesoid X and TGR5 receptors in hepatobiliary and intestinal diseases. Hepatobiliary Pancreat Dis Int. 2015;14(1):18–33. DOI: 10.1016/s1499-3872(14)60307-6</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Stanimirov B., Stankov K., Mikov M. Bile acid signaling through farnesoid X and TGR5 receptors in hepatobiliary and intestinal diseases. Hepatobiliary Pancreat Dis Int. 2015;14(1):18–33. DOI: 10.1016/s1499-3872(14)60307-6</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit24"><label>24</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Martinez-Augustin O., Sanchez de Medina F. Intestinal bile acid physiology and pathophysiology. World J Gastroenterol. 2008;14(37):5630–40. DOI: 10.3748/wjg.14.5630</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Martinez-Augustin O., Sanchez de Medina F. Intestinal bile acid physiology and pathophysiology. World J Gastroenterol. 2008;14(37):5630–40. DOI: 10.3748/wjg.14.5630</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit25"><label>25</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Aw W., Fukuda S. An integrated outlook on the metagenome and metabolome of intestinal diseases. Diseases. 2015;3(4):341–59. DOI: 10.3390/diseases3040341</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Aw W., Fukuda S. An integrated outlook on the metagenome and metabolome of intestinal diseases. Diseases. 2015;3(4):341–59. DOI: 10.3390/diseases3040341</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit26"><label>26</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">O'Connell T.M. The application of metabolomics to probiotic and prebiotic interventions in human clinical studies. Metabolites. 2020;10(3):120. DOI: 10.3390/metabo10030120</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">O'Connell T.M. The application of metabolomics to probiotic and prebiotic interventions in human clinical studies. Metabolites. 2020;10(3):120. DOI: 10.3390/metabo10030120</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
