Практические рекомендации Научного сообщества по содействию клиническому изучению микробиома человека (НСОИМ) и Российской гастроэнтерологической ассоциации (РГА) по диагностике и лечению синдрома избыточного бактериального роста у взрослых

Цель публикации. Оптимизировать выбор лечебной тактики врачей первичного звена здравоохранения, терапевтов и гастроэнтерологов для улучшения результатов лечения и профилактики синдрома избыточного бактериального роста (СИБР) у взрослых.

Основные положения. СИБР представляет собой состояние, характеризующееся повышенным количеством и/или нарушением состава микробиоты в тонкой кишке. Клинически синдром проявляется неспецифическими гастроэнтерологическими жалобами и развитием синдрома мальабсорбции. Чаще всего СИБР ассоциирован с различными хроническими неинфекционными заболеваниями (как заболеваниями желудочно-кишечного тракта, так и сердечно-сосудистой системы и нервно-мышечного аппарата) и может оказывать влияние на выраженность их симптомов. Специфическими методами диагностики СИБР являются культуральный метод и дыхательные тесты. Основные подходы к лечению СИБР включают устранение основной причины его возникновения, прием антибактериальных препаратов и соблюдение диетических рекомендаций (элементарной диеты).

Вывод. Синдром избыточного бактериального роста часто встречается у пациентов с различными заболеваниями, однако характеризуется неспецифическими проявлениями, что делает актуальным стандартизацию диагностики данного состояния. Терапия СИБР подразумевает назначение антибактериальных средств, наиболее изученным из которых является невсасывающийся антибиотик рифаксимин-α.

1. Achufusi T.G.O., Sharma A., Zamora E.A., Manocha D. Small Intestinal Bacterial Overgrowth: Comprehensive Review of Diagnosis, Prevention, and Treatment Methods. Cureus. 2020;12(6):e8860. DOI: 10.7759/cureus.8860

2. Министерство Здравоохранения Российской Федерации. Приказ 9 июня 2003 г. № 231 «Об утверждении отраслевого стандарта “Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника”». https://docs.cntd.ru/document/901869098

3. Choung R.S., Ruff K.C., Malhotra A., Herrick L., Locke G.R. 3rd, Harmsen W.S., Zinsmeister A.R., Talley N.J., Saito Y.A. Clinical predictors of small intestinal bacterial overgrowth by duodenal aspirate culture. Aliment Pharmacol Ther. 2011;33(9):1059–67. DOI: 10.1111/j.1365-2036.2011.04625.x

4. Erdogan A., Rao S.S., Gulley D., Jacobs C., Lee Y.Y., Badger C. Small intestinal bacterial overgrowth: duodenal aspiration vs glucose breath test. Neurogastroenterol Motil. 2015;27(4):481–9. DOI: 10.1111/nmo.12516

5. Grace E., Shaw C., Whelan K., Andreyev H.J. Review article: small intestinal bacterial overgrowth-prevalence, clinical features, current and developing diagnostic tests, and treatment. Aliment Pharmacol Ther. 2013;38(7):674– 88. DOI: 10.1111/apt.12456

6. Maslennikov R., Pavlov C., Ivashkin V. Small intestinal bacterial overgrowth in cirrhosis: systematic review and meta-analysis. Hepatol Int. 2018;12(6):567–76. DOI: 10.1007/s12072-018-9898-2

7. Song Y., Liu Y., Qi B., Cui X., Dong X., Wang Y., et al. Association of Small Intestinal Bacterial Overgrowth With Heart Failure and Its Prediction for Short-Term Outcomes. J Am Heart Assoc. 2021;10(7):e015292. DOI: 10.1161/JAHA.119.015292

8. Фадеева М.В., Схиртладзе М.Р., Ивашкин В.Т. Синдром избыточного бактериального роста в тонкой кишке как фактор риска развития желудочковой тахикардии при хронической сердечной недостаточности с систолической дисфункцией левого желудочка. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2019;29(3):38-48 DOI: 10.22416/1382-4376-2019-29-3-38-48

9. Поцхверашвили Н.Д., Зольникова О.Ю., Кокина Н.И., Джахая Н.Л., Седова А.В., Буеверова Е.Л., Трухманов А.С. Синдром избыточного бактериального роста у больных бронхиальной астмой. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2018;28(4): 47-54. DOI: 10.22416/1382-4376-2018-28-4-47-54

10. Villette R., Kc P., Beliard S., Salas Tapia M.F., Rainteau D., Guerin M., Lesnik P. Unraveling HostGut Microbiota Dialogue and Its Impact on Cholesterol Levels. Front Pharmacol. 2020;11:278. DOI: 10.3389/fphar.2020.00278

11. Gabbard S.L., Lacy B.E., Levine G.M., Crowell M.D. The impact of alcohol consumption and cholecystectomy on small intestinal bacterial overgrowth. Dig Dis Sci. 2014;59(3):638–44. DOI: 10.1007/s10620-013-2960-y

12. Yoshii K., Hosomi K., Sawane K., Kunisawa J. Metabolism of Dietary and Microbial Vitamin B Family in the Regulation of Host Immunity. Front Nutr. 2019;6:48. DOI: 10.3389/fnut.2019.00048

13. Martinez-Guryn K., Leone V., Chang E.B. Regional Diversity of the Gastrointestinal Microbiome. Cell Host Microbe. 2019;26(3):314–24. DOI: 10.1016/j.chom.2019.08.011

14. Wu W., Chen F., Liu Z., Cong Y. Microbiota-specific Th17 Cells: Yin and Yang in Regulation of Inflammatory Bowel Disease. Inflamm Bowel Dis. 2016;22(6):1473–82. DOI: 10.1097/MIB.0000000000000775

15. Behnsen J., Jellbauer S., Wong C.P., Edwards R.A., George M.D., Ouyang W., Raffatellu M. The cytokine IL-22 promotes pathogen colonization by suppressing related commensal bacteria. Immunity. 2014;40(2):262–73. DOI: 10.1016/j.immuni.2014.01.003

16. Hooper L.V., Macpherson A.J. Immune adaptations that maintain homeostasis with the intestinal microbiota. Nat Rev Immunol. 2010;10(3):159–69. DOI: 10.1038/nri2710

17. Cash H.L., Whitham C.V., Behrendt C.L., Hooper L.V. Symbiotic bacteria direct expression of an intestinal bactericidal lectin. Science. 2006;313(5790):1126–30. DOI: 10.1126/science.1127119

18. Everard A., Lazarevic V., Gaïa N., Johansson M., Ståhlman M., Backhed F., et al. Microbiome of prebiotic-treated mice reveals novel targets involved in host response during obesity. ISME J. 2014;8(10):2116–30. DOI: 10.1038/ismej.2014.45

19. Denning T.L., Sitaraman S.V. Segmented filamentous bacteria shape intestinal immunity. Gastroenterology. 2010;139(1):351–3. DOI: 10.1053/j.gastro.2010.05.032

20. Sachdev A.H., Pimentel M. Gastrointestinal bacterial overgrowth: pathogenesis and clinical significance. Ther Adv Chronic Dis. 2013;4(5):223–31. DOI: 10.1177/2040622313496126

21. Pyleris E., Tzivras D., Barbatzas C., Giamarellos-Bourboulis E.J., Koussoulas V., Pimentel M. The prevalence of overgrowth by aerobic bacteria in the small intestine by small bowel culture: Relationship with irritable bowel syndrome. Dig Dis Sci. 2012:57(5):1321–9. DOI: 10.1007/s10620-012-2033-7

22. Leite G., Morales W., Weitsman S., Celly S., Parodi G., Mathur R., et al. The duodenal microbiome is altered in small intestinal bacterial overgrowth. PLoS One. 15(7):e0234906. DOI: 10.1371/journal.pone.0234906

23. Takakura W., Pimentel M. Small Intestinal Bacterial Overgrowth and Irritable Bowel Syndrome — An Update. Front Psychiatry. 2020;11:664. DOI: 10.3389/fpsyt.2020.00664

24. Ghoshal U.C. How to interpret hydrogen breath tests. J Neurogastroenterol Motil. 2011;17(3):312–7. DOI: 10.5056/jnm.2011.17.3.312

25. Gandhi A., Shah A., Jones M.P., Koloski N., Talley N.J., Morrison M., Holtmann G. Methane positive small intestinal bacterial overgrowth in inflammatory bowel disease and irritable bowel syndrome: A systematic review and meta-analysis. Gut Microbes. 2021;13(1):1933313. DOI:10.1080/19490976.2021.1933313

26. Ghashghaeinia M., Mrowietz U. Human erythrocytes, nuclear factor kappaB (NFκB) and hydrogen sulfide (H2 S) — from non-genomic to genomic research. Cell Cycle. 2021;20(20):2091–101. DOI: 10.1080/15384101.2021.1972557

27. Suri J., Kataria R., Malik Z., Parkman H.P., Schey R. Elevated methane levels in small intestinal bacterial overgrowth suggests delayed small bowel and colonic transit. Medicine (Baltimore). 2018 May;97(21):e10554. DOI: 10.1097/MD.0000000000010554

28. Bures J., Cyrany J., Kohoutova D., Förstl M., Rejchrt S., Kvetina J., et al. Small intestinal bacterial overgrowth syndrome. World J Gastroenterol. 2010;16(24):2978–90. DOI: 10.3748/wjg.v16.i24.2978

29. Montoro-Huguet M.A., Belloc B., Domínguez-Cajal M. Small and Large Intestine (I): Malabsorption of Nutrients. Nutrients. 2021;13(4):1254. DOI: 10.3390/nu13041254

30. Lakhani S.V., Shah H.N., Alexander K., Finelli F.C., Kirkpatrick J.R., Koch T.R. Small intestinal bacterial overgrowth and thiamine deficiency after Rouxen-Y gastric bypass surgery in obese patients. Nutr Res. 2008;28(5):293–8. DOI: 10.1016/j.nutres.2008.03.002

31. Parlesak A., Klein B., Schecher K., Bode J.C., Bode C. Prevalence of small bowel bacterial overgrowth and its association with nutrition intake in nonhospitalized older adults. J Am Geriatr Soc. 2003;51(6):768–73. DOI: 10.1046/j.1365-2389.2003.51259.x

32. Maslennikov R., Pavlov C., Ivashkin V. Is small intestinal bacterial overgrowth a cause of hyperdynamic circulation in cirrhosis? Turk J Gastroenterol. 2019;30(11):964– 75. DOI: 10.5152/tjg.2019.18551

33. Ivashkin K.V., Grechishnikova V.R., Reshetova M.S., Ivashkin V.T. Irritable Bowel and Bacterial Overgrowth Syndromes: a Bacterial Link Hypothesis of Functional Disease. Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, Coloproctology. 2021;31(1):54–63 (In Russ.). DOI: 10.22416/1382-4376-2021-31-1-54-63

34. Jones R.M., Neish A.S. Recognition of bacterial pathogens and mucosal immunity. Cell Microbiol. 2011;13(5):670–6. DOI: 10.1111/j.1462-5822.2011.01579.x

35. Shah A., Morrison M., Burger D., Martin N., Rich J., Jones M., et al. Systematic review with meta-analysis: the prevalence of small intestinal bacterial overgrowth in inflammatory bowel disease. Aliment Pharmacol Ther. 2019;49(6):624–35. DOI: 10.1111/apt.15133

36. Rao S.S.C., Tan G., Abdulla H., Yu S., Larion S., Leelasinjaroen P. Does colectomy predispose to small intestinal bacterial (SIBO) and fungal overgrowth (SIFO)? Clin Transl Gastroenterol. 2018;9(4):146. DOI: 10.1038/s41424-018-0011-x

37. Polkowska-Pruszyńska B., Gerkowicz A., Szczepanik-Kułak P., Krasowska D. Small intestinal bacterial overgrowth in systemic sclerosis: a review of the literature. Arch Dermatol Res. 2019;311(1):1–8. DOI: 10.1007/s00403-018-1874-0

38. Patil A.D. Link between hypothyroidism and small intestinal bacterial overgrowth. Indian J Endocrinol Metab. 2014;18(3):307–9. DOI: 10.4103/2230-8210.131155

39. Feng X., Li X.Q. The prevalence of small intestinal bacterial overgrowth in diabetes mellitus: a systematic review and meta-analysis. Aging (Albany NY). 2022;14(2): 975–88. DOI: 10.18632/aging.203854

40. Lee A.A., Baker J.R., Wamsteker E.J., Saad R., DiMagno M.J. Small Intestinal Bacterial Overgrowth Is Common in Chronic Pancreatitis and Associates With Diabetes, Chronic Pancreatitis Severity, Low Zinc Levels, and Opiate Use. Am J Gastroenterol. 2019;114(7):1163–71. DOI: 10.14309/ajg.0000000000000200

41. Chander Roland B., Mullin G.E., Passi M., Zheng X., Salem A., Yolken R., Pasricha P.J. A Prospective Evaluation of Ileocecal Valve Dysfunction and Intestinal Motility Derangements in Small Intestinal Bacterial Overgrowth. Dig Dis Sci. 2017;62(12):3525–35. DOI: 10.1007/s10620-017-4726-4

42. Su T., Lai S., Lee A., He X., Chen S. Meta-analysis: proton pump inhibitors moderately increase the risk of small intestinal bacterial overgrowth. J Gastroenterol. 2018;53(1):27–36. DOI: 10.1007/s00535-017-1371-9

43. Reddymasu S.C., McCallum R.W. Small intestinal bacterial overgrowth in gastroparesis: are there any predictors? J Clin Gastroenterol. 2010;44(1):e8–13. DOI: 10.1097/MCG.0b013e3181aec746

44. Esposito S., Biscarini A., Federici B., Cofini M., Argentiero A., Neglia C., et al. Role of Small Intestinal Bacterial Overgrowth (SIBO) and Inflammation in Obese Children. Front Pediatr. 2020; 8:369. DOI: 10.3389/fped.2020.00369

45. Hegade V.S., Speight .R.A, Etherington R.E., Jones D.E. Novel bile acid therapeutics for the treatment of chronic liver diseases. Therap Adv Gastroenterol. 2016;9(3): 376–91. DOI: 10.1177/1756283X16630712

46. Losurdo G., Marra A., Shahini E., Girardi B., Giorgio F., Amoruso A., et al. Small intestinal bacterial overgrowth and celiac disease: A systematic review with pooleddata analysis. Neurogastroenterol Motil. 2017;29(6). DOI: 10.1111/nmo.13028

47. El Kurdi B., Babar S., El Iskandarani M., Bataineh A., Lerch M.M., Young M., Singh V.P. Factors That Affect Prevalence of Small Intestinal Bacterial Overgrowth in Chronic Pancreatitis: A Systematic Review, Meta-Analysis, and Meta-Regression. Clin Transl Gastroenterol. 2019;10(9):e00072. DOI: 10.14309/ctg.0000000000000072

48. Miazga A., Osiński M., Cichy W., Żaba R. Current views on the etiopathogenesis, clinical manifestation, diagnostics, treatment and correlation with other nosological entities of SIBO. Adv Med Sci. 2015;60(1):118–24. DOI: 10.1016/j.advms.2014.09.001

49. Wang F.Y., Chi C.C. Rosacea, Germs, and Bowels: A Review on Gastrointestinal Comorbidities and Gut-Skin Axis of Rosacea. Adv Ther. 2021;38(3):1415–24. DOI: 10.1007/s12325-021-01624-x

50. Ghosh G., Jesudian A.B. Small Intestinal Bacterial Overgrowth in Patients With Cirrhosis. J Clin Exp Hepatol. 2019;9(2):257–67. DOI: 10.1016/j.jceh.2018.08.006

51. Khoshini R., Dai S.C., Lezcano S., Pimentel M. A systematic review of diagnostic tests for small intestinal bacterial overgrowth. Dig Dis Sci. 2008;53(6):1443–54. DOI: 10.1007/s10620-007-0065-1

52. Tang Q., Jin G., Wang G., Liu T., Liu X., Wang B., Cao H. Current Sampling Methods for Gut Microbiota: A Call for More Precise Devices. Front Cell Infect Microbiol. 2020;10(151). DOI: 10.3389/fcimb.2020.00151

53. Kastl A.J. Jr, Terry N.A., Wu G.D., Albenberg L.G. The Structure and Function of the Human Small Intestinal Microbiota: Current Understanding and Future Directions. Cell Mol Gastroenterol Hepatol. 2020;9(1):33–45. DOI: 10.1016/j.jcmgh.2019.07.006

54. Pimentel M., Saad R.J., Long M.D., Rao S.S.C. ACG Clinical Guideline: Small Intestinal Bacterial Overgrowth. Am J Gastroenterol. 2020;115(2):165–78. DOI: 10.14309/ajg.0000000000000501

55. Rao S.S.C., Bhagatwala J. Small Intestinal Bacterial Overgrowth: Clinical Features and Therapeutic Management. Clin Transl Gastroenterol. 2019;10(10):e00078. DOI: 10.14309/ctg.0000000000000078

56. Rezaie A., Buresi M., Lembo A., Lin H., McCallum R., Rao S., et al. Hydrogen and Methane-Based Breath Testing in Gastrointestinal Disorders: The North American Consensus. Am J Gastroenterol. 2017;112(5):775–84. DOI: 10.1038/ajg.2017.46

57. Hammer H.F., Fox M.R., Keller J., Salvatore S., Basilisco G., Hammer J., et al; European H2 -CH4 -breath test group. European guideline on indications, performance, and clinical impact of hydrogen and methane breath tests in adult and pediatric patients: European Association for Gastroenterology, Endoscopy and Nutrition, European Society of Neurogastroenterology and Motility, and European Society for Paediatric Gastroenterology Hepatology and Nutrition consensus. United European Gastroenterol J. 2022;10(1):15–40. DOI: 10.1002/ueg2.12133

58. Attar A., Flourié B., Rambaud J.C., Franchisseur C., Ruszniewski P., Bouhnik Y. Antibiotic efficacy in small intestinal bacterial overgrowth-related chronic diarrhea: a crossover, randomized trial. Gastroenterology. 1999;117(4):794–7. DOI: 10.1016/s0016-5085(99)70336-7

59. Maconi G., Hausken T., Dietrich C.F., Pallotta N., Sporea I., Nurnberg D., et al. Gastrointestinal Ultrasound in Functional Disorders of the Gastrointestinal Tract — EFSUMB Consensus Statement. Ultrasound Int Open. 2021;7(1):E14–24. DOI: 10.1055/a-1474-8013

60. Greenson J.K. The biopsy pathology of non-coeliac enteropathy. Histopathology. 2015;66(1):29–36. DOI: 10.1111/his.12522

61. Приказ Министерства здравоохранения РФ от 28 февраля 2019 г. № 103н «Об утверждении порядка и сроков разработки клинических рекомендаций, их пересмотра, типовой формы клинических рекомендаций и требований к их структуре, составу и научной обоснованности включаемой в клинические рекомендации информации» (с изменениями и дополнениями).

62. Ghoshal U.C., Srivastava D., Misra A., Ghoshal U. A proof-of-concept study showing antibiotics to be more effective in irritable bowel syndrome with than without small-intestinal bacterial overgrowth: a randomized, double-blind, placebo-controlled trial. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2016;28(3):281–9. DOI: 10.1097/MEG.0000000000000557

63. Sajjad A., Mottershead M., Syn W.K., Jones R., Smith S., Nwokolo C.U. Ciprofloxacin suppresses bacterial overgrowth, increases fasting insulin but does not correct low acylated ghrelin concentration in non-alcoholic steatohepatitis. Aliment Pharmacol Ther. 2005;22(4): 291–9. DOI: 10.1111/j.1365-2036.2005.02562.x

64. Castiglione F., Rispo A., Di Girolamo E., Cozzolino A., Manguso F., Grassia R., Mazzacca G. Antibiotic treatment of small bowel bacterial overgrowth in patients with Crohn's disease. Aliment Pharmacol Ther. 2003;18 (11–12):1107–12. DOI: 10.1046/j.1365-2036.2003.01800.x

65. Gatta L., Scarpignato C. Systematic review with meta-analysis: rifaximin is effective and safe for the treatment of small intestine bacterial overgrowth. Aliment Pharmacol Ther. 2017;45(5):604–16. DOI: 10.1111/apt.13928

66. Pimentel M., Constantino T., Kong Y., Bajwa M., Rezaei A., Park S. A 14-day elemental diet is highly effective in normalizing the lactulose breath test. Dig Dis Sci. 2004;49(1):73–7. DOI: 10.1023/b:ddas.0000011605.43979.e1

67. Bellini M., Tonarelli S., Nagy A.G., Pancetti A., Costa F., Ricchiuti A., et al. Low FODMAP Diet: Evidence, Doubts, and Hopes. Nutrients. 2020;12(1):148. DOI: 10.3390/nu12010148

68. Lauritano E.C., Gabrielli M., Scarpellini E., Lupascu A., Novi M., Sottili S., et al. Small intestinal bacterial overgrowth recurrence after antibiotic therapy. Am J Gastroenterol. 2008;103(8):2031–5. DOI: 10.1111/j.1572-0241.2008.02030.x

69. Kunkel D., Basseri R.J., Makhani M.D., Chong K., Chang C., Pimentel M. Methane on breath testing is associated with constipation: a systematic review and meta-analysis. Dig Dis Sci. 2011;56(6):1612–8. DOI: 10.1007/s10620-011-1590-5

70. Rosenthal A., Solomons N.W. Time-course of cigarette smoke contamination of clinical hydrogen breath-analysis tests. Clin Chem. 1983;29(11):1980–1. PMID: 6627640